近日,中國熱科院橡膠所分子育種團隊成功研制出基于靶向基因型檢測技術的橡膠樹40K育種芯片,對建立橡膠樹高效生物育種體系、提高天然橡膠育種自主創(chuàng)新能力具有積極意義。
研究團隊基于4531個與橡膠樹重要農藝性狀相關的基因和QTL標記位點,以及35282個在基因組均勻分布的高質量SNP作為背景位點,成功研制出具有代表性、全局性和功能性標記位點的橡膠樹40K育種芯片。
橡膠樹40K育種芯片具有分布均勻、多態(tài)性高等特點,可廣泛應用于橡膠樹遺傳多樣性評估、種質資源精準鑒定、群體遺傳結構分析、遺傳圖譜構建、全基因組關聯(lián)分析以及全基因組選擇育種等研究領域。研究團隊利用該芯片對223份橡膠樹種質資源開展功能基因組分析和基因組選擇育種研究,實現(xiàn)了高效的群體劃分、種質資源遺傳背景解析、重要農藝性狀QTL位點挖掘,并開展全基因組選擇和育種模擬,共篩選出50對具有潛在優(yōu)勢的速生親本組合,推動橡膠樹育種從傳統(tǒng)的經(jīng)驗育種向精準高效的分子育種轉變。該芯片的研制有助于縮短橡膠育種周期,提升育種效率,加快我國橡膠樹育種技術體系升級。
橡膠樹40K育種芯片在遺傳研究和基因組育種中的應用
相關研究成果以“Development of the rubber tree 40K breeding chip with applications in genetic study and breeding prediction”為題發(fā)表在中科院一區(qū)Top期刊《Industrial Crops and Products》。中國熱科院橡膠所王小波助理研究員為論文第一作者,程漢研究員為通訊作者。該研究得到國家重點研發(fā)計劃、海南省科技人才創(chuàng)新項目、國家自然科學基金、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務費專項、中國熱帶農業(yè)科學院國家熱帶農業(yè)科學中心科技創(chuàng)新團隊項目以及熱帶作物生物育種全國重點實驗室科研項目的資助。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2025.120640
責任編輯:天然橡膠處