近日,中國熱科院橡膠所分子育種團(tuán)隊(duì)成功研制出基于靶向基因型檢測技術(shù)的橡膠樹40K育種芯片,對建立橡膠樹高效生物育種體系、提高天然橡膠育種自主創(chuàng)新能力具有積極意義。
研究團(tuán)隊(duì)基于4531個(gè)與橡膠樹重要農(nóng)藝性狀相關(guān)的基因和QTL標(biāo)記位點(diǎn),以及35282個(gè)在基因組均勻分布的高質(zhì)量SNP作為背景位點(diǎn),成功研制出具有代表性、全局性和功能性標(biāo)記位點(diǎn)的橡膠樹40K育種芯片。
橡膠樹40K育種芯片具有分布均勻、多態(tài)性高等特點(diǎn),可廣泛應(yīng)用于橡膠樹遺傳多樣性評估、種質(zhì)資源精準(zhǔn)鑒定、群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、遺傳圖譜構(gòu)建、全基因組關(guān)聯(lián)分析以及全基因組選擇育種等研究領(lǐng)域。研究團(tuán)隊(duì)利用該芯片對223份橡膠樹種質(zhì)資源開展功能基因組分析和基因組選擇育種研究,實(shí)現(xiàn)了高效的群體劃分、種質(zhì)資源遺傳背景解析、重要農(nóng)藝性狀QTL位點(diǎn)挖掘,并開展全基因組選擇和育種模擬,共篩選出50對具有潛在優(yōu)勢的速生親本組合,推動(dòng)橡膠樹育種從傳統(tǒng)的經(jīng)驗(yàn)育種向精準(zhǔn)高效的分子育種轉(zhuǎn)變。該芯片的研制有助于縮短橡膠育種周期,提升育種效率,加快我國橡膠樹育種技術(shù)體系升級。
橡膠樹40K育種芯片在遺傳研究和基因組育種中的應(yīng)用
相關(guān)研究成果以“Development of the rubber tree 40K breeding chip with applications in genetic study and breeding prediction”為題發(fā)表在中科院一區(qū)Top期刊《Industrial Crops and Products》。中國熱科院橡膠所王小波助理研究員為論文第一作者,程漢研究員為通訊作者。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、海南省科技人才創(chuàng)新項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金、中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)、中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)中心科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目以及熱帶作物生物育種全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室科研項(xiàng)目的資助。
論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.indcrop.2025.120640
責(zé)任編輯:天然橡膠處